根据网络搜索结果，复星医药近年来与多款新药相关的首付款信息如下（按披露时间排序）：
1. 与特宝生物合作的“珮金”（重组人粒细胞刺激因子注射液）
- 首付款金额：3000万元人民币（协议生效后一次性支付）。
- 信息来源：特宝生物2023年5月31日在互动平台披露，复星医药子公司江苏复星医药销售有限公司与特宝生物签署独家商业化协议，除首付款外，还涉及里程碑款项（累计不低于7300万元）。
2. 与BioNTech合作的mRNA新冠疫苗（BNT162b2）
- 首付款金额：合计2.5亿欧元（约20亿元人民币），分两笔支付：
- 首期首付款1.25亿欧元（2020年12月30日前支付）；
- 剩余1.25亿欧元（疫苗在中国大陆获批上市后支付）。
- 信息来源：复星医药2020年12月16日公告调整后的协议，涉及首批5000万剂疫苗的付款安排。
3. 与Lilly合作的BCL-2抑制剂（FCN-338）
- 首付款金额：4000万美元（协议生效后30日内支付）。
- 信息来源：复星医药2020年11月1日公告，控股子公司复创医药授予Lilly该产品除中国内地、香港及澳门外的独家权利，累计里程碑款项不超过4.4亿美元（含首付款）。
4. 与英矽智能合作的AI药物研发
- 首付款金额：1300万美元（约8294万元人民币）。
- 信息来源：2022年1月11日披露，双方共同推进多个靶点的AI药物研发，刷新国内AI制药合作首付款纪录。
注：上述“两款新药”未明确具体指向，若为近期市场关注的核心项目，**mRNA新冠疫苗（2.5亿欧元）与FCN-338（4000万美元）或珮金（3000万元人民币）**为主要标的。具体需以公司最新公告为准。